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ONT全長轉錄組測序是指基于牛津納米孔公司（Oxford Nanopore Technologies，ONT）三代測序平臺進行全長轉錄組測序。
全長轉錄組測序（full-length transcriptome sequencing），又稱為Isoform Sequencing（Iso-Seq），無需打斷，基于三代測序平臺直接獲取轉錄本的5ˊ到3ˊ高質量全長序列，可準確識別可變剪接、基因融合、可選擇性多聚腺苷酸化APA、等位基因特異性表達等轉錄本結構方面變異?；趎anopore三代測序平臺進行全長轉錄組測序，除了可準確鑒別上述轉錄本結構變異，還可實現轉錄本（mRNA或polyA+ lncRNA）表達水平準確定量。