Stereo-seq芯片上布滿了數(shù)十億規(guī)則陣列排布的單鏈線球狀 DNA 納米球(DNA NanoBall,DNB)。DNB 是以單鏈環(huán)狀DNA 為模板、經(jīng)過滾環(huán)擴增(Rolling-Circle Replication,RCR)后得到的產(chǎn)物,每個 DNB 直徑為 220 nm,兩個 DNB中心點間距范圍為 500 nm。攜帶空間條形碼(Coordinate lD,CID)的DNB鏈接分子編碼 (Molecular ID,MID)和PolyT后,可以實現(xiàn)游離 mRNA和蛋白抗體上的ADT分子的捕獲。通過測序得到CID 信息,CID 和DNB 坐標位置一一對應(yīng)。建立CID 與坐標位置的映射關(guān)系后,實現(xiàn)mRNA 和ADT 空間位置的還原。
人和小鼠的新鮮凍存樣本


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